Bahçe Bitkileri Anabilim Dalı, ilk olarak 2013 yılında Ahi Evran Üniversitesi, Ziraat Fakültesi, Bahçe Bitkileri Bölümü ile ortak yüksek lisans programı şeklinde açılmıştır. Daha sonra 2019 yılında Yozgat Bozok Üniversitesi Fen Bilimleri Enstitüsü’nde tek program olarak eğitim öğretime başlamıştır. 06.02.2021 tarih ve 31387 sayılı Resmi Gazete Cumhurbaşkanlığı' nın 3518 sayılı kararı ile Yozgat Bozok Üniversitesi Lisansüstü Eğitim Enstitüsü bünyesinde devam etmektedir.

Anabilim Dalımız eğitim-öğretim ve araştırma faaliyetlerini 6 Doçent, 2 Doktor Öğretim Üyesi, 2 Doktor Araştırma Görevlisi ve 1 Doktor Öğretim Görevlisi tarafından sağlanmaktadır.

Bahçe Bitkileri Anabilim Dalı’nda; meyve, sebze, bağ, ve süs bitkilerinin biyolojisi, yetiştiriciliği, ıslahı ve biyoteknolojisi ile  bitki, tohum fizyolojisi konularında yüksek lisans düzeyinde eğitim ve araştırma çalışmaları yapılmaktadır.