Erciyes Üniversitesine bağlı olarak, 03.07.1992 tarih ve 3837 sayılı kanunun 16. maddesi uyarınca “Yozgat Ziraat Fakültesi” olarak kurulan fakültemiz, 01.03.2006 tarih ve 5467 sayılı kanunun 1. maddesi uyarınca yeni kurulan Bozok Üniversitesine bağlanarak “Bozok Üniversitesi Ziraat Fakültesi” ismini almıştır. 10.09.2012 tarih ve 28407 sayılı Resmi Gazetede yayımlanan 2012/3640 Sayılı Bakanlar Kurulu Kararı ile “Tarım ve Doğa Bilimleri Fakültesi” olarak değiştirilen Fakültemizin ismi, mevzuatla ilgili yaşanan bazı sorunlar nedeniyle, 08.04.2016 tarih ve 29678 sayılı Resmi Gazetede yayımlanan 2016/8555 Sayılı Bakanlar Kurulu Kararı ile tekrar “Ziraat Fakültesi” olarak değiştirilmiştir.
Fakültemizde 2010-2011 eğitim öğretim yılında Tarla Bitkileri Bölümünde lisans eğitimi başlamıştır. Tarla Bitkileri Anabilim Dalı Yüksek Lisans programı 2010-2011 eğitim öğretim yılında açılmış ve öğrenci kabul etmiştir. Anabilim dalı Doktora Programı ise Yozgat Bozok Üniversitesi Lisansüstü Eğitim Enstitüsü Bünyesinde 2020 yılında kurulmuş ve öğrenci alımına başlamıştır.